Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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