Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms