Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms