Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR64

KLHL1, Kelch-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL1Q9NR64 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL1Q9NR64 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms