Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8S5

CNTD2, Cyclin N-terminal domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD2Q9H8S5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTD2Q9H8S5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTD2Q9H8S5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTD2Q9H8S5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTD2Q9H8S5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTD2Q9H8S5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTD2Q9H8S5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTD2Q9H8S5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTD2Q9H8S5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms