Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR55Q9H6Y2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR55Q9H6Y2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms