Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms