Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU5

KRTAP2-1, Keratin-associated protein 2-1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-1Q9BYU5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP2-1Q9BYU5 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP2-1Q9BYU5 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms