Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRRTQ9BXP5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRRTQ9BXP5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRRTQ9BXP5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRRTQ9BXP5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRRTQ9BXP5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRRTQ9BXP5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRRTQ9BXP5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRRTQ9BXP5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRRTQ9BXP5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRRTQ9BXP5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRRTQ9BXP5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRRTQ9BXP5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRRTQ9BXP5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRRTQ9BXP5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRRTQ9BXP5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms