Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms