Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms