Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms