Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms