Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms