Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms