Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms