Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC8EQ6NSJ5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms