Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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COL5A1-AS1Q5SY13 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
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COL5A1-AS1Q5SY13 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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COL5A1-AS1Q5SY13 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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COL5A1-AS1Q5SY13 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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COL5A1-AS1Q5SY13 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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COL5A1-AS1Q5SY13 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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