Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms