Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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