Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TWIST1Q15672 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms