Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
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