Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTMR3Q13615 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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