Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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ERCC8Q13216 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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ERCC8Q13216 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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ERCC8Q13216 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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