Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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TRAF3Q13114 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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TRAF3Q13114 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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TRAF3Q13114 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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TRAF3Q13114 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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TRAF3Q13114 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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