Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
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