Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms