Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms