Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SPCS3P61009 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPCS3P61009 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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SPCS3P61009 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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SPCS3P61009 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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SPCS3P61009 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPCS3P61009 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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