Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms