Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP9P55211 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP9P55211 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP9P55211 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP9P55211 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP9P55211 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP9P55211 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP9P55211 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP9P55211 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP9P55211 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP9P55211 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP9P55211 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP9P55211 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP9P55211 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP9P55211 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP9P55211 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP9P55211 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP9P55211 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP9P55211 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP9P55211 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP9P55211 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP9P55211 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP9P55211 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP9P55211 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP9P55211 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP9P55211 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP9P55211 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP9P55211 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms