Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJC1P36383 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJC1P36383 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms