Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTX3P26022 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTX3P26022 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTX3P26022 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTX3P26022 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTX3P26022 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTX3P26022 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTX3P26022 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTX3P26022 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTX3P26022 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTX3P26022 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms