Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3BP20337 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms