Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF3P18847 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF3P18847 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF3P18847 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF3P18847 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF3P18847 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF3P18847 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF3P18847 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF3P18847 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF3P18847 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF3P18847 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF3P18847 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF3P18847 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF3P18847 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF3P18847 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF3P18847 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF3P18847 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF3P18847 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF3P18847 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF3P18847 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF3P18847 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF3P18847 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF3P18847 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF3P18847 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF3P18847 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF3P18847 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF3P18847 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF3P18847 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF3P18847 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF3P18847 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF3P18847 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF3P18847 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF3P18847 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF3P18847 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF3P18847 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF3P18847 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF3P18847 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF3P18847 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF3P18847 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF3P18847 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF3P18847 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF3P18847 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF3P18847 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF3P18847 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF3P18847 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF3P18847 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF3P18847 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF3P18847 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF3P18847 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF3P18847 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF3P18847 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF3P18847 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF3P18847 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF3P18847 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF3P18847 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF3P18847 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF3P18847 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF3P18847 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF3P18847 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF3P18847 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF3P18847 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF3P18847 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF3P18847 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF3P18847 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF3P18847 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF3P18847 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF3P18847 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF3P18847 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF3P18847 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF3P18847 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF3P18847 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF3P18847 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF3P18847 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF3P18847 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF3P18847 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF3P18847 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF3P18847 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF3P18847 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF3P18847 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF3P18847 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF3P18847 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF3P18847 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF3P18847 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF3P18847 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF3P18847 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF3P18847 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF3P18847 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF3P18847 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF3P18847 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF3P18847 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF3P18847 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF3P18847 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF3P18847 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF3P18847 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF3P18847 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF3P18847 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF3P18847 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF3P18847 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF3P18847 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF3P18847 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms