Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms