Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA4P12838 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA4P12838 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA4P12838 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA4P12838 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA4P12838 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA4P12838 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA4P12838 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA4P12838 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA4P12838 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA4P12838 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms