Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA1P02647 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA1P02647 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA1P02647 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA1P02647 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA1P02647 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA1P02647 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA1P02647 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA1P02647 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA1P02647 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA1P02647 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA1P02647 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA1P02647 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA1P02647 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA1P02647 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA1P02647 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA1P02647 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA1P02647 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA1P02647 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA1P02647 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA1P02647 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA1P02647 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA1P02647 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA1P02647 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA1P02647 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA1P02647 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA1P02647 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA1P02647 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA1P02647 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms