Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms