Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD2APQ9Y5K6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD2APQ9Y5K6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms