Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms