Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms