Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CROTQ9UKG9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms