Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PRKCD-203ENST00000464818 777 ntTSL 518.12■□□□□ 0.492e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM62-209ENST00000568182 493 ntTSL 318.1■□□□□ 0.492e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 PRKCD-206ENST00000487897 562 ntTSL 418.01■□□□□ 0.472e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 TFEB-215ENST00000445214 365 ntTSL 517.98■□□□□ 0.472e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.462e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 DUXAP10-210ENST00000624585 4667 ntTSL 217.84■□□□□ 0.452e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 Z98749.2-209ENST00000455209 792 ntTSL 317.84■□□□□ 0.452e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.432e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.432e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.412e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.42e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 UBXN2B-202ENST00000520732 684 ntTSL 317.51■□□□□ 0.392e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 ZXDC-204ENST00000515545 2635 ntTSL 1 (best)17.45■□□□□ 0.382e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.382e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 CHMP1A-209ENST00000550872 533 ntTSL 217.41■□□□□ 0.382e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FAM3A-220ENST00000497506 568 ntTSL 317.37■□□□□ 0.372e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.342e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.322e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 Z98749.2-210ENST00000454577 468 ntTSL 316.96■□□□□ 0.312e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.32e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.32e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.297e-8■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FAM3A-206ENST00000412894 832 ntTSL 516.81■□□□□ 0.282e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FRMD4A-201ENST00000264546 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.73■□□□□ 0.272e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 CHMP1A-206ENST00000549139 812 ntTSL 216.69■□□□□ 0.262e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.242e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 PPP2R1A-210ENST00000490868 668 ntTSL 216.54■□□□□ 0.242e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.242e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.232e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 ZXDC-203ENST00000514463 4639 ntTSL 1 (best)16.42■□□□□ 0.222e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 LMAN2L-206ENST00000446780 1400 ntTSL 216.4■□□□□ 0.222e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.182e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 LMAN2L-204ENST00000434865 1163 ntTSL 216.14■□□□□ 0.172e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 LST1-221ENST00000490742 273 ntTSL 516.08■□□□□ 0.162e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.162e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 GK5-208ENST00000480757 4479 ntTSL 1 (best)16.03■□□□□ 0.162e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.152e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.142e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.142e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.132e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.132e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.122e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 TFEB-212ENST00000424495 377 ntTSL 1 (best)15.76■□□□□ 0.112e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.12e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 MAD1L1-223ENST00000496548 639 ntTSL 515.69■□□□□ 0.12e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 GK5-212ENST00000492097 3049 ntTSL 1 (best)15.67■□□□□ 0.12e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 LMAN2L-205ENST00000440610 1008 ntTSL 215.66■□□□□ 0.12e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 LMAN2L-207ENST00000449221 1061 ntTSL 215.66■□□□□ 0.12e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FAM3A-209ENST00000421517 853 ntTSL 315.61■□□□□ 0.092e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FAM3A-219ENST00000492763 587 ntTSL 315.61■□□□□ 0.092e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.092e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 BAHCC1-203ENST00000582709 563 ntTSL 315.54■□□□□ 0.082e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 TPM2-207ENST00000604975 573 ntTSL 515.41■□□□□ 0.062e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.032e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.032e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 VPS33B-208ENST00000574755 2356 ntTSL 215.21■□□□□ 0.032e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.022e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.022e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 RPLP0P2-205ENST00000492786 573 ntTSL 415.04■□□□□ -02e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 LDAH-203ENST00000402479 493 ntTSL 315.03■□□□□ -01e-14■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 CHMP1A-210ENST00000551981 689 ntTSL 215.01□□□□□ -0.012e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.012e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 GRSF1-204ENST00000505068 3561 ntTSL 214.87□□□□□ -0.032e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 SLC19A1-206ENST00000460174 600 ntTSL 314.86□□□□□ -0.032e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 PEMT-205ENST00000421096 662 ntTSL 314.74□□□□□ -0.052e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 LST1-219ENST00000464044 278 ntTSL 314.63□□□□□ -0.072e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FBF1-202ENST00000585990 4481 ntTSL 214.58□□□□□ -0.081e-14■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FRMD4A-207ENST00000492155 2731 ntTSL 214.5□□□□□ -0.092e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.092e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.092e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 LST1-213ENST00000396112 382 ntTSL 514.41□□□□□ -0.12e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.112e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FAM3A-213ENST00000440318 441 ntTSL 514.02□□□□□ -0.172e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 AC122688.3-201ENST00000623804 3467 ntBASIC14□□□□□ -0.172e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.21e-14■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FBF1-201ENST00000319129 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.74□□□□□ -0.211e-14■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FUT10-205ENST00000518076 1221 ntTSL 413.72□□□□□ -0.211e-14■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 PPP2R1A-206ENST00000468280 688 ntTSL 213.68□□□□□ -0.222e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 COG6-204ENST00000455146 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.232e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 KLHDC4-205ENST00000446344 4444 ntBASIC13.56□□□□□ -0.242e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 LMAN2L-203ENST00000434524 2410 ntTSL 513.49□□□□□ -0.252e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.262e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.262e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.262e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.262e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.262e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.262e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.262e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.262e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.262e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FUT10-211ENST00000524021 2042 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.261e-14■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 VPS33B-201ENST00000333371 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.262e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 RPLP0P2-201ENST00000475331 591 ntTSL 413.34□□□□□ -0.272e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 RPLP0P2-202ENST00000475561 598 ntTSL 413.27□□□□□ -0.292e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 RPLP0P2-203ENST00000478959 573 ntTSL 413.24□□□□□ -0.292e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 PANK4-212ENST00000515423 430 ntTSL 313.18□□□□□ -0.32e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FBF1-212ENST00000636174 3626 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.311e-14■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 TFEB-214ENST00000433032 168 ntTSL 1 (best)13.04□□□□□ -0.322e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 ARF1P2-201ENST00000392493 538 ntBASIC12.87□□□□□ -0.352e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.382e-11■■■■■ 173.1
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 572.6 ms