Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
UTP23Q9BRU9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP23Q9BRU9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms