Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms