Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms