Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms