Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms