Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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